Wir stehen für kreative Forschung

Die Arbeitsgruppe

Experimentelle Onkogenomik

Gruppenleitung: PD Mag. Dr. rer. nat. Gerold Untergasser

Das Labor für Experimentelle Onkogenomik beschäftigt sich mit der Etablierung von Assays zur Detektion von Mutationen bzw. der Messung von Biomarkern in Patientenproben (Liquid Biopsies) und der funktionellen Untersuchung von potenziellen Onkogenen in Zellkultursystemen bzw. in vivo Tumor Modellen. 

Projekte:

1) GRP78 vermittelte Resistenzbildung gegen Chemotherapeutika

Therapie-resistente Tumorzellen verlagern eine soluble Form des Endoplasmatischen Retikulum-(ER) Chaperon-Proteins GRP78 auf ihre Zellmembran und sezernieren dies unter Stressbedingungen in ihre Umgebung. GRP78 aktiviert Überlebenssignale auf der Zellmembran von Tumorzellen (Intrinsic Resistance) und unterstützt die Tumorzellen über die Aktivierung benachbarter Zellen im Stroma (Extrinsic Resistance). Dadurch sind Endothelzellen vor anti-angiogenen Substanzen geschützt und Immunzellen werden in ihrer anti-tumoralen Aktivität negativ beeinflusst. Ziel dieses Projekts ist die Aufklärung der molekularen Mechanismen mittels in vitro und in vivo Tumor Modellen.  

2) EpCAM, ein Biomarker für Krebstherapien

Epitheliale Tumore produzieren verstärkt das Oberflächenprotein EpCAM. EpCAM wird ähnlich wie NOTCH in Tumorzellen und Stammzellen durch Membran-assoziierte Proteasen in einen solublen extrazellulären Teil (EpEX) und ein intrazelluläres Peptid (EpICD) gespalten. EpICD verstärkt die WNT-induzierte Transkription von c-myc. In diesem Projekt wird in klinischen Proben das Prozessieren von EpCAM untersucht bzw. die soluble EpEX Form in Liquid Biopsies von Patienten mittels eines validierten ELISA Systems gemessen.   

3) Mutationsanalytik mittels Amplicon-Next Generation Sequenzierung (NGS)

In Zusammenarbeit mit dem Labor für klinische Onkogenomik (Diagnostik) soll eine neue diagnostische Plattform (NGS) etabliert werden, mit der kosteneffizient Therapie- und Diagnostik-relevante Veränderungen von Genen im hämatologischen und soliden Tumoren erfasst werden können. In diesem Projekt wird ein Markerprofil etabliert, das alle bekannten genomischen Veränderungen (Mutationen) bei hämatologischen Erkrankungen erfasst, die für Therapieentscheidungen und Prognostik relevant sind. In einem weiteren Schritt soll mittels tumortypischen DNA-Spuren (Driver-Mutationen) aus Serum/Plasma und anderen Körperflüssigkeiten ("liquid biopsies") ein Mutationsprofil etabliert werden. Mit Hilfe dieser Daten soll der Nachweis einer Minimalen Resterkrankung (MRD) nach Tumortherapien und die frühzeitige Entdeckung von soliden Primärtumoren bzw. Tumorrezidiven verbessert werden.   

Zum Forschungsschwerpunkt

Molekulare Onkologie

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Das Tiroler Krebsforschungsinstitut hat sich ein mittelfristiges Ziel gesetzt: in enger Zusammenarbeit von Forschern und Klinikern sollen neue Krebstherapiekonzepte am Institut entwickelt und zum klinischen Einsatz gebracht werden. Dieses ehrgeizige Ziel unterstreicht den kreativen Optimismus, der die gesamte Initiative beseelt.
Gruppenleitung: PD Mag. Dr. rer. nat. Gerold Untergasser

Publikationen

Steiner N, Borjan B, Hajek R, Jöhrer K, Göbel G, Willenbacher W, Kern J, Gunsilius E, Untergasser G. Oncotarget 2017, doi: 10.18632/oncotarget.17353

Steiner N, Hajek R, Sevcikova S, Borjan B, Jöhrer K, Göbel G, Untergasser G, Gunsilius E. PLoS One 2017, 12(7):e0181487

Borjan B, Steiner N, Karbon S, Kern J, Francesch A, Hermann M, Willenbacher W, Gunsilius E, Untergasser G. BMC Cancer 2015, 15:738

Martowicz A, Seeber A, Untergasser G. Histol Histopathol 2016, 31(4):349-55

Seeber A, Braicu I, Untergasser G, Nassir M, Fong D, Botta L, Gastl G, Fiegl H, Zeimet A, Sehouli J, Spizzo G. Oncotarget 2015, 6(28):25017-23

Steiner N, Ribatti D, Willenbacher W, Jöhrer K, Kern J, Marinaccio C, Aracil M, García-Fernández LF, Gastl G, Untergasser G, Gunsilius E. Oncotarget 2015, 6(10):8200-9

Seeber A, Martowicz A, Spizzo G, Buratti T, Obrist P, Fong D, Gastl G, Untergasser G. BMC Cancer 2015, 15(1):372

Thangavadivel S, Zelle-Rieser C, Olivier A, Postert B, Untergasser G, Kern J, Brunner A, Gunsilius E, Biedermann R, Hajek R, Pour L, Willenbacher W, Greil R, Jöhrer K. Oncotarget 2016, 7(48):78605-78618

Seeber A, Untergasser G, Spizzo G, Terracciano L, Lugli A, Kasal A, Kocher F, Steiner N, Mazzoleni G, Gastl G, Fong D. Int J Cancer 2016, 139(3):657-63

Schimke MM, Stigler R, Wu X, Waag T, Buschmann P, Kern J, Untergasser G, Rasse M, Steinmüller-Nethl D, Krueger A, Lepperdinger G. Nanomedicine 2016, (3):823-33

Pircher A, Jöhrer K, Kocher F, Steiner N, Graziadei I, Heidegger I, Pichler R, Leonhartsberger N, Kremser C, Kern J, Untergasser G, Gunsilius E, Hilbe W. Oncotarget 2016, 7(15):20109-23